因为通过祈祷、冥思和神灵沟通的难度越来越大，获得神灵的神术也越来越少，威力更是日渐减弱，特别是以一些对传教最为有利的治疗类神术减弱得最为严重，其中绝大部分治疗神术只剩下一些光影幻象，只有更高级的神官、祭司或者主教才能够发挥出一部分治疗效果。
为此，正教庭不得不做出一些改变，付出一些代价，换取医学院的支持，专门给各个教会培养一些教会医生。
医学院对此乐见其成，因为这会让医学院的影响力借助教会的势力扩张更广，带来的附加利益也自然是越多。
只不过，影响往往都是双向的，在医学院开始影响各个教会思想的同时，教会的神灵信仰也渗透到了医学院内部，甚至在医学院内也建立起了一些教会神灵的小教堂，供人祈祷、礼拜。
正因为这种特殊的氛围，使得教会医生也开始尝试着将各自教派的基础信仰和医学院的自然医学结合到一起，试图建立一种融合科学和信仰的新型教派。只是，这种尝试都失败了，最终弄出来的教派不伦不类，甚至连教会医生都看不过去，主动将这些失败品销毁掉。
直到一名信仰植物之母的教会医生约书亚无意中从医学院图书馆独到了这本书，或者更正确的来说独到了这本书的序章，他就像是获得了神灵启示一样，迅速的将这篇序章的内容宗教化、神格化，并且在短短不到三天时间，就编写了一套完整的核心思想和教派体系，正式创立了治愈教会。
治愈教会的核心思想和那篇序章一脉相承，都是认为维纶世界现在已经病了，需要治疗，而治疗的方法两者则截然不同，那篇文章的治疗方法主要是保护环境，维护生态，而治愈教会则将维纶世界生病归咎于神灵的消失和沉睡，所以他们认为只要神灵回归，那么维纶世界也将重新恢复秩序。
就和维纶世界其他一些秘密学会和地下教会一样，一开始加入治愈教会的人很少，只有十三人，医学院的人笑称他们为十三门徒，而约书亚则被调侃式的称为圣子。
治愈教会建立最开始的几年里，所做的事情也并没有什么奇特的地方，他们做得最多的事情就是培育或者寻找一些能够帮助各个教会教徒在冥思祈祷时更容易进入状态的草药，同时也和考古学界发掘一些古迹等等。
直到，某一日美加利加王国的天空之主教会突然抓捕约书亚，并且在医学院反应过来之前，以渎神罪将其处死，他的十三门徒，一人背叛，十二人逃散，治愈教会才出现在世界各国的眼中。
只不过，这时候更多的注意力是聚焦在天空之主教会和医学院在正教庭打的这场宗教官司，因为这场官司会成为一个标准案例，从法律上解决宗教教规和各国司法发生冲突时所遭遇到的问题。
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